La crioterapia de brotes tiene varias ventajas sobre los métodos tradicionales de erradicación de patógenos: Produce libres de patógenos con alta frecuencia. Elimina eficazmente los virus que pueden ser difíciles de eliminar con otras técnicas tradicionales. Las plantas libres de patógenos pueden obtenerse más rápidamente que cuando se utilizan otros métodos. Permite el uso de ápices de brotes más grandes, evitando la escisión de tejidos muy pequeños que consume mucho tiempo. Puede usarse en combinación con otras técnicas (termoterapia o quimioterapia), particularmente para patógenos que infectan las células meristemáticas.