Secara umum, penyakit tanaman dapat disebabkan oleh dua kelompok besar, yaitu:

Penyebab biotik (organis / parasit / patogen)

Penyebab abiotik (anorganis / fisiopat)

Penyebab biotik adalah makhluk hidup yang menimbulkan penyakit pada tanaman karena berinteraksi langsung dengan jaringan tanaman dan mengambil nutrisi dari inangnya.

salah satu Ciri umum penyakit biotik:

Penyakit tidak dapat menular  dari tanaman satu ke tanaman lain.

Jamur adalah organisme mikroskopis bersel tunggal yang tidak berklorofil dan berkembang biak dengan membelah diri.

Xanthomonas campestris → Hawar daun pada padi dan kubis. adalah contoh penyakit dari kelompok jamur

Virus adalah partikel submikroskopis (lebih kecil dari bakteri) yang hanya dapat hidup dan berkembang biak di dalam sel hidup (intraseluler obligat).

Mengisap cairan sel akar dan menyebabkan pembengkakan (gall), akar bercabang abnormal, atau layu akibat gangguan penyerapan air dan hara. hal tersebut dilakukan oleh bakteri

Penyebab abiotik (fisiopat) bukan disebabkan oleh organisme hidup, tetapi oleh faktor lingkungan atau kondisi fisik dan kimia yang tidak sesuai dengan kebutuhan tanaman.